R语言/FAERS/论文写作中的一些问题——①MedDRA

发布日期：2025-05-21 12:26    点击次数：198

一、本篇目的

提供MedDRA的EXCEL表

简单说一下编码过程

二、关于MedDRA的几个点

MedDRA的中文名是《监管活动医学词典》，个人认为，其实就是一个标准，把医学中的一些术语进行标准化，便于整个监管过程（上市前至上市后）的交流

MeDRA不仅可以编码不良反应，病历中的病情描述等也可以使用MedDRA进行编码

MedDRA有SOC/HLGT/HLT/PT/LLT等5个层级

如果要求你对一个不良反应或者一段病情描述使用MedDRA进行编码，一般在LLT层级进行

FAERS数据库中或药品说明书中提到的不良反应术语，一般是PT层级（首选语）

论文中经常在SOC层级进行分析，当然有需要也可以在HLT/HLGT层级进行分析

MeDRA每年3月和9月进行两次更新，最新版本是27.0，今年9月份更新27.1版本

版本更新过程中，有时会涉及层级调整，例如某些PT调整为LLT

可以在B站/西瓜视频/腾讯视频搜索MedDRA，会有MedDRA中文官方提供的教学视频

MedDRA对医院/学校/监管部门等公益性单位是免费的，但是需要申请，有条件的老师可以尝试申请正版使用，申请过程中，最好使用单位或学校邮箱

三、给大家提供一个MedDRA的excel版

我也不知道这个版本是哪年的版本，可以用来练习，想要最新的版本只能另外去找

这个表中pt层级和llt层级整合到了一列，即pt列

下载地址: https://pan.baidu.com/s/15VWdZ_5iXS0YmFB_Kr3ShQ

四、关于FAERS数据挖掘结果中阳性PT的编码

FAERS数据库中的不良反应编码本身就是采用MedDRA标准，所以只需要把挖掘阳性PT结果，以pt列作为key，使用left_join左连接，和上面提供的excel进行连接，就可以得到结果。连接的时候，最好把两个表格的pt列全部转换成小写，不然可能出现无法匹配的情况。过程比较简单，不再给出程序。也可以通过正版MedDRA进行编码，过程可能略显繁琐，不细说，有正版MedDRA的老师可以自行研究。前面有提到，随着更新，术语层级会发生变化，在进行阳性PT结果编码的过程中，会出现在PT层级无法找到对应编码的情况，可以尝试在LLT层级再次进行编码FAERS数据库中的PT列的很少一部分填写并不是很规范，无法精准编码，个人觉得可以放弃这部分MeDRA编码具有多轴性，excel表中也提供了是否是主SOC，根据需要进行查看即可 本站仅提供存储服务，所有内容均由用户发布，如发现有害或侵权内容，请点击举报。